蛋白质是由氨基酸序列组成，但真正决定蛋白质作用的是它的3D结构，即氨基酸序列的折叠方式，如下图的示例。蛋白质结构发现的主要方法，包括X-ray晶体衍射法、核磁共振法，以及2013年后成为热门的冷冻电镜三维重构法等。但是冷冻电镜采购成本高昂，图像重构需要耗费大量的计算力，往往需要很长时间才能解出一个新的蛋白质3D结构。

1972年诺贝尔化学奖得主，美国生物化学家克里斯蒂安. 安芬森提出：给定一个氨基酸序列，理论上就能预测出蛋白质的3D结构。五十年来，为了验证这个理论，科学家尝试各种模型预测蛋白质结构的方法，但是在全球蛋白质结构预测领域最知名的CASP竞赛中，直到2018年预测准确率的成绩只是40%上下。